Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3bQ9CZT8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms