Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmss1Q9CZT6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms