Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl55Q9CZ83 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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