Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CYI0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CYI0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CYI0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYI0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYI0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYI0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYI0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CYI0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CYI0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYI0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms