Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Malsu1Q9CWV0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms