Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nrxn1Q9CS84 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nrxn1Q9CS84 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Nrxn1Q9CS84 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nrxn1Q9CS84 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nrxn1Q9CS84 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nrxn1Q9CS84 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nrxn1Q9CS84 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nrxn1Q9CS84 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nrxn1Q9CS84 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nrxn1Q9CS84 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nrxn1Q9CS84 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nrxn1Q9CS84 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms