Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rwdd1Q9CQK7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms