Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chmp3Q9CQ10 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms