Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms