Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms