Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlcd1Q99JT6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms