Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Derl1Q99J56 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms