Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SptssbQ925E8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms