Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clip1Q922J3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms