Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf6Q91YR7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms