Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1bQ91YK2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1bQ91YK2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms