Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubtd1Q91WB7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubtd1Q91WB7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubtd1Q91WB7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubtd1Q91WB7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubtd1Q91WB7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubtd1Q91WB7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubtd1Q91WB7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms