Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn8Q91VA3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn8Q91VA3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms