Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK0

Tmem30a, Cell cycle control protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30aQ8VEK0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30aQ8VEK0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem30aQ8VEK0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms