Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kdm4cQ8VCD7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4cQ8VCD7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms