Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms