Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B2

Mcfd2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcfd2Q8K5B2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcfd2Q8K5B2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mcfd2Q8K5B2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms