Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stn1Q8K2X3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stn1Q8K2X3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms