Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LgsnQ8CIX8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LgsnQ8CIX8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms