Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc63Q8CDV6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc63Q8CDV6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms