Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc38Q8CDN8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms