Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB59

Fam161b, Protein FAM161B, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam161bQ8CB59 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam161bQ8CB59 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam161bQ8CB59 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam161bQ8CB59 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms