Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gpc5Q8CAL5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc5Q8CAL5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc5Q8CAL5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc5Q8CAL5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc5Q8CAL5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc5Q8CAL5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc5Q8CAL5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms