Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc142Q8CAI1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc142Q8CAI1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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