Protein–RNA interactions for Protein: Q8C804

Spice1, Spindle and centriole-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spice1Q8C804 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spice1Q8C804 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spice1Q8C804 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms