Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi27Q8C6G0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi27Q8C6G0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifi27Q8C6G0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms