Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp5Q8BX09 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms