Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pggt1bQ8BUY9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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