Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gjd4Q8BSD4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjd4Q8BSD4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjd4Q8BSD4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms