Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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