Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Negr1Q80Z24 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Negr1Q80Z24 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms