Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AknaQ80VW7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AknaQ80VW7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AknaQ80VW7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
AknaQ80VW7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AknaQ80VW7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AknaQ80VW7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AknaQ80VW7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AknaQ80VW7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AknaQ80VW7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
AknaQ80VW7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC32■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC32■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
AknaQ80VW7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
AknaQ80VW7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms