Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc1Q80VQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc1Q80VQ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms