Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna12Q80SS5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms