Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Znf250Q7TNU6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms