Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNF0

Doc2a, Double C2-like domain-containing protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Doc2aQ7TNF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Doc2aQ7TNF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Doc2aQ7TNF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Doc2aQ7TNF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Doc2aQ7TNF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Doc2aQ7TNF0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Doc2aQ7TNF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Doc2aQ7TNF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms