Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Higd1cQ76I25 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1cQ76I25 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1cQ76I25 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms