Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Efr3bQ6ZQ18 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Efr3bQ6ZQ18 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efr3bQ6ZQ18 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms