Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf653Q6YND2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf653Q6YND2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf653Q6YND2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms