Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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