Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms