Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfrkbQ6PIJ4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms