Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip4Q6PHZ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms