Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dhx40Q6PE54 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms