Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc2Q6PDG5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms